Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms