Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp3Q3ULW8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp3Q3ULW8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms