Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms