Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms