Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smu1Q3UKJ7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms