Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms