Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms