Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms