Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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