Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem109Q3UBX0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem109Q3UBX0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms