Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms