Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms