Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf149Q3U2C5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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