Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms