Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc28Q3TX51 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms