Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms