Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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