Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms