Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTJ4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms