Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calr4Q3TQS0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms