Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam107bQ3TGF2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms