Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms