Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc2Q3SXD3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms