Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdss1Q33DR2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdss1Q33DR2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms