Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm1Q2TV84 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms