Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms