Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm1123Q1RME4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm1123Q1RME4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms