Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms