Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms