Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sap25Q1EHW4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms