Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam47cQ14BE7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam47cQ14BE7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms