Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rpusd2Q149F1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rpusd2Q149F1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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