Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms