Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp4r2Q0VGB7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms