Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab42Q0PD08 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms