Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps8Q0P5W1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms