Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NeblQ0II04 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NeblQ0II04 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms