Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssrp1Q08943 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms