Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms