Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MestQ07646 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MestQ07646 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MestQ07646 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MestQ07646 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MestQ07646 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MestQ07646 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MestQ07646 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MestQ07646 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms