Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms