Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r236Q05A06 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms