Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Thbs3Q05895 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Thbs3Q05895 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Thbs3Q05895 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Thbs3Q05895 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs3Q05895 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Thbs3Q05895 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Thbs3Q05895 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms