Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcn1Q05186 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms