Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms