Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms