Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox10Q04888 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox10Q04888 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox10Q04888 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox10Q04888 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms