Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox8Q04886 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms