Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxcr5Q04683 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms