Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnb1Q03717 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms